Werner Wirth wurde am 1. Oktober 1961 zur Bundeswehr eingezogen. Seine Grundausbildung absolvierte Werner Wirth im Pionierbataillon Höxter, AusbKp 4/7.
Danach wechselte er am 19.12.1961 in die 5. Kompanie des Pionierbataillons Höxter und verließ die Bundeswehr am 31. März 1963 als Obergefreiter.